準噶爾生態(tài)環(huán)境觀測研究站前身為“新疆荒漠生態(tài)定位研究站”，1984年，由原國家環(huán)保局批準了原新疆環(huán)保所（現(xiàn)新疆維吾爾自治區(qū)環(huán)境保護科學(xué)研究院）“荒漠生態(tài)定位研究”課題立項后建立，經(jīng)過10年的野外生態(tài)觀測研究，取得了豐碩的科研成果。1994年課題結(jié)束后，因缺乏持續(xù)科研經(jīng)費投入，該站除保留4.3km2觀測研究用地和舊站建筑物之外，全部科研工作處于停滯狀態(tài)，原有的觀測研究硬件設(shè)備全部報廢淘汰。2010年新疆維吾爾自治區(qū)環(huán)境保護科學(xué)研究院院領(lǐng)導(dǎo)班子調(diào)整之后，新一屆院領(lǐng)導(dǎo)班子確立了“科研立院、人才強院、特色興院”的發(fā)展思路，并決定重建野外觀測研究站，定名為“新疆準噶爾生態(tài)環(huán)境觀測研究站”，主要任務(wù)是基于生態(tài)基線調(diào)查，建立環(huán)境背景數(shù)據(jù)庫，開展生態(tài)環(huán)境現(xiàn)狀及生物多樣性定位觀測研究。經(jīng)過充分調(diào)研和論證，結(jié)合新疆當(dāng)前社會經(jīng)濟發(fā)展的現(xiàn)狀和生態(tài)環(huán)境保護工作的實際需求，確定了“以烏魯木齊河為主線，從天山一號冰川到東道海子垂直分布帶生態(tài)系統(tǒng)、準噶爾盆地南緣荒漠綠洲交錯帶生態(tài)演變和重大人為活動對綠洲荒漠生態(tài)環(huán)境影響”三大方向觀測研究定位，并于2010年下半年開始邊建設(shè)邊觀測研究。2011年6月底，環(huán)境保護部周生賢部長視察新疆維吾爾自治區(qū)環(huán)境保護科學(xué)研究院，聽取新疆準噶爾生態(tài)環(huán)境觀測研究站工作匯報后，給予了充分肯定，并要求將其納入國家環(huán)境保護野外觀測研究體系。2012年，該觀測研究站經(jīng)環(huán)境保護部批準正式納入中國環(huán)境科學(xué)研究院野外生態(tài)環(huán)境觀測研究站體系，由中國環(huán)境科學(xué)研究院與新疆維吾爾自治區(qū)環(huán)境保護科學(xué)研究院共同建設(shè)運行，全面開展生態(tài)環(huán)境長期綜合觀測。
　　觀測站位于準噶爾盆地南緣，北靠古爾班通古特沙漠，南依烏魯木齊河、頭屯河及三屯河下游綠洲，是典型的荒漠綠洲交錯帶；地理坐標范圍為44029，26”~44030728”N，87030748”~87032r36”E，海拔430m，占地面積4.3km2，距烏魯木齊直線距離85km。以烏魯木齊河流域（一號冰川一東道海子）完整的垂直帶譜為觀測范圍，以荒漠綠洲交錯帶和國家經(jīng)濟技術(shù)開發(fā)區(qū)甘泉堡工業(yè)園區(qū)為重點觀測區(qū)域，以植被、土壤、地下水、大氣、氣候等生態(tài)環(huán)境要素的綜合觀測為主要觀測內(nèi)容，以荒漠生態(tài)系統(tǒng)演替、生態(tài)水文過程、生物多樣性、生態(tài)環(huán)境對氣候變化和人類活動的響應(yīng)為重點研究方向，探索準噶爾盆地荒漠生態(tài)系統(tǒng)演變規(guī)律以及區(qū)域經(jīng)濟社會發(fā)展對生態(tài)環(huán)境的影響，為環(huán)境保護應(yīng)用研究及環(huán)境管理提供技術(shù)支撐。通過觀測站的基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)和觀測研究能力建設(shè)，逐步形成具有荒漠生態(tài)學(xué)、綠洲生態(tài)學(xué)及污染生態(tài)學(xué)等學(xué)科的研究能力，形成多尺度、全面、長期連續(xù)監(jiān)測、模擬和解決多學(xué)科的關(guān)鍵科學(xué)問題的能力，為生態(tài)環(huán)境管理提供基礎(chǔ)科學(xué)支撐。最終把觀測站建成具有國內(nèi)先進水平的基礎(chǔ)性、綜合性、長期性生態(tài)學(xué)與環(huán)境科學(xué)觀測的研究基地，先進的科技成果試驗、示范基地，優(yōu)秀的科學(xué)人才培養(yǎng)基地，高度開放的國內(nèi)外學(xué)術(shù)交流基地。
　　新疆準噶爾生態(tài)環(huán)境觀測研究站重建以來，對烏魯木齊河流域的野生動植物資源進行了4年的觀測調(diào)查，調(diào)查范圍沿烏魯木齊河，從一號冰川一大西溝水庫一烏拉泊水庫一青格達湖一觀測站一東道海子（見烏魯木齊河流域范圍圖），包括冰雪裸巖帶、高山墊狀植被帶、高山亞高山草甸帶、中山針葉林帶、山地草原及灌木草甸草原帶、荒漠草原帶、荒漠帶、沙漠植被帶等完整的植被垂直帶，開展12條樣線，50多個樣地的觀測和調(diào)查。重點調(diào)查了陸生脊椎動物繁殖期（夏季）、遷徙期（春、秋兩季）的群落，物種的構(gòu)成、生活習(xí)性，以及植被群落的空間格局、物種構(gòu)成、蓋度、多度、生物量等指標，采集500余株植物，制作植物標本119種，制作動物標本20余件。